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FPGA+深度學(xué)習(xí)技術(shù) 助力智慧醫(yī)療

在醫(yī)改大政策風(fēng)向標(biāo)的背后,是資本逐鹿試水,商業(yè)試錯(cuò)?;ヂ?lián)網(wǎng)+醫(yī)療成為構(gòu)建新時(shí)代下智慧醫(yī)療的生態(tài)圈。但是,醫(yī)療信息化就等于真正的智慧醫(yī)療嗎?或者說只是智慧醫(yī)療的基礎(chǔ)?若論更加務(wù)實(shí)的智慧醫(yī)療則是在信息化基礎(chǔ)上的幫助診療,本文主要論述了FPGA+深度學(xué)習(xí)技術(shù)如何助力智慧醫(yī)療落地。
資訊頻道文章B

  醫(yī)療信息化≠真正智慧醫(yī)療

  “十三五”強(qiáng)調(diào)要促進(jìn)健康中國(guó)的建設(shè),其中智慧醫(yī)療被提上日程,智慧醫(yī)療成為深化醫(yī)改、推進(jìn)健康中國(guó)建設(shè)的重要技術(shù)手段。智慧醫(yī)療在百度的解釋是通過打造健康檔案區(qū)域醫(yī)療信息平臺(tái),利用最先進(jìn)的物聯(lián)網(wǎng)技術(shù),實(shí)現(xiàn)患者與醫(yī)務(wù)人員、醫(yī)療機(jī)構(gòu)、醫(yī)療設(shè)備之間的互動(dòng),逐步達(dá)到信息化。作為建設(shè)智慧城市的一部分,智慧醫(yī)療對(duì)緩解看病難這一社會(huì)問題具有積極的推動(dòng)作用,但是,如果把智慧醫(yī)療僅僅定義為醫(yī)療信息化,未免有些狹隘。

  不可置否,目前醫(yī)療產(chǎn)業(yè)面臨的大醫(yī)院人滿為患,社區(qū)醫(yī)院無人問津,病人就診手續(xù)繁瑣、看病難等等問題,都是由于醫(yī)療信息不暢,醫(yī)療資源兩極化等原因?qū)е碌?。近年來,醫(yī)療改革在醫(yī)療信息化的浪潮中取得了巨大成就,可以使患者用較短的等療時(shí)間、支付基本的醫(yī)療費(fèi)用,就可以享受安全、便利、優(yōu)質(zhì)的診療服務(wù)。比如目前部分醫(yī)院支持在線預(yù)約專家、微信掛號(hào)及在線支付等功能,以及未來電子病歷及健康檔案的落地,可以減少了病人的等診時(shí)間及削減看病成本,但這并不是智慧醫(yī)療的全部。

  幫助診療也是智慧醫(yī)療的重要部分。杭州健培科技有限公司CEO程國(guó)華表示,目前國(guó)內(nèi)智慧醫(yī)療看到的只是醫(yī)療信息化這一基礎(chǔ)層面。針對(duì)一個(gè)醫(yī)院的信息化,軟件工程師基本可以全部搞定,但是真正做到智慧醫(yī)療,僅僅做醫(yī)療信息化是遠(yuǎn)遠(yuǎn)不夠的,智慧醫(yī)療最重要的是洞察大量非結(jié)構(gòu)化大數(shù)據(jù)背后的價(jià)值,以幫助醫(yī)生在最短的時(shí)間內(nèi)做出最精確的診斷。

  在幫助診療方面,目前國(guó)內(nèi)僅局限于不到10%的結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)的利用,而對(duì)于大量的非結(jié)構(gòu)化醫(yī)學(xué)影像數(shù)據(jù)缺乏認(rèn)知分析。由海歸博士團(tuán)隊(duì)聯(lián)手成立的杭州健培科技有限公司,從2014年開始與國(guó)內(nèi)外著名的研究機(jī)構(gòu)和高等院校展開合作,致力于醫(yī)學(xué)影像大數(shù)據(jù)分析技術(shù)(MIBA)的研發(fā)及應(yīng)用,并通過深度學(xué)習(xí)技術(shù),建立人工智能診斷系統(tǒng),幫助醫(yī)生診斷各種疾病,推動(dòng)我國(guó)醫(yī)療創(chuàng)新領(lǐng)域理念從“方便診療”走向“幫助診療”,以此改變我國(guó)醫(yī)療衛(wèi)生資源分配不平衡、看病難、看病貴等問題。

  深度學(xué)習(xí)技術(shù)與疾病診斷

  當(dāng)下“互聯(lián)網(wǎng)+”推動(dòng)了醫(yī)療行業(yè)大數(shù)據(jù)爆炸,據(jù)權(quán)威調(diào)查數(shù)據(jù)顯示,醫(yī)療行業(yè)非結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)占整個(gè)數(shù)據(jù)量的90%左右,醫(yī)療行業(yè)的非結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)主要包括醫(yī)療PACS系統(tǒng)產(chǎn)生的醫(yī)學(xué)影像,比如DR,CR,MRI等,如果能夠深挖這些海量影像數(shù)據(jù)背后的價(jià)值,將對(duì)精準(zhǔn)醫(yī)療研究、個(gè)體化治療、疾病治療與療效評(píng)價(jià)、重大疾病的風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估等具有重要的意義。目前,通過深度學(xué)習(xí)技術(shù),可以解讀醫(yī)療影像數(shù)據(jù),這在國(guó)外已經(jīng)有不少落地性案例,比如,今年倫敦帝國(guó)理工大學(xué)就宣布運(yùn)用深度學(xué)習(xí)技術(shù)為基礎(chǔ)的腦部影像圖像分析工具,以協(xié)助醫(yī)生診斷大腦出現(xiàn)的損傷情況。但目前國(guó)內(nèi)在醫(yī)學(xué)圖像分析領(lǐng)域的應(yīng)用案例還是一片空白。

  對(duì)此,健培科技在國(guó)內(nèi)率先利用自主研發(fā)的“兩朵云”產(chǎn)品進(jìn)入醫(yī)療影像分析領(lǐng)域,即HealthView駐地云和HealthView診斷云。HealthView駐地云能有效的對(duì)醫(yī)院的非結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)存儲(chǔ)系統(tǒng)整合和優(yōu)化配置,進(jìn)而為診斷云提供了數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)。而診斷云側(cè)重于非結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)的分析和挖掘,將影像數(shù)據(jù)的重要臨床實(shí)用價(jià)值發(fā)揮出來。比如長(zhǎng)久困擾放射科的肺癌早期和乳腺癌早期篩查誤診率居高不下的問題,通過計(jì)算機(jī)智能診斷的精確性,能夠極大的降低人為閱片的誤診率,通過計(jì)算機(jī)的高性能和不間斷運(yùn)行,也能有效減輕放射科醫(yī)生的工作負(fù)荷,從而改善整個(gè)放射科的工作效率和質(zhì)量,最終提升患者就醫(yī)體驗(yàn)。

  從技術(shù)創(chuàng)新角度而言,程國(guó)華說,“傳統(tǒng)的基于Hadoop的大數(shù)據(jù)處理平臺(tái),有很多弊端,而且性價(jià)比也不高。隨著醫(yī)院云平臺(tái)需求的深入,原來的架構(gòu)已不能承載。目前Spark架構(gòu)是最先進(jìn)的,雖然Spark概念已提出幾年,但是在醫(yī)療行業(yè)的應(yīng)用還是全新的。對(duì)于醫(yī)療影像大數(shù)據(jù)應(yīng)用來講,它不僅能將性能提升至幾十倍甚至上百倍,同時(shí)可以降低存儲(chǔ)需求。”基于Spark架構(gòu)的駐地云可以幫助醫(yī)院進(jìn)行存儲(chǔ)、分享及傳輸醫(yī)療影像數(shù)據(jù),還可以進(jìn)行即時(shí)的交互,在此基礎(chǔ)上嫁接診斷云,整個(gè)醫(yī)院將變成智能化。

  HealthView診斷云在駐地云的基礎(chǔ)上,結(jié)合最新人工智能算法,實(shí)現(xiàn)海量相似病例檢索和醫(yī)學(xué)影像智能診斷,極大地幫助醫(yī)生進(jìn)行定位病癥、分析病情和指導(dǎo)手術(shù),屬于“臨床決策系統(tǒng)”的一部分,也是醫(yī)學(xué)科技發(fā)展的前沿方向。利用深度學(xué)習(xí)技術(shù)結(jié)合云計(jì)算平臺(tái)對(duì)醫(yī)學(xué)影像做分析,可以大大提高醫(yī)生的診斷率。據(jù)了解,放射科醫(yī)生診斷效率可以從原先的半小時(shí)一個(gè)病人到1分鐘一個(gè)病人,精準(zhǔn)度從70%到85%到90%的一個(gè)逐一變化來提高整個(gè)醫(yī)院的診斷效率與準(zhǔn)確度。這種幫助診療在一定程度上大大縮短了病人的等療時(shí)間,而且可以得到最精確的診斷。

  目前由健培科技聯(lián)合建立的研發(fā)實(shí)驗(yàn)室,首先是通過對(duì)肺部影像分析來診斷各種疾病,程國(guó)華表示,醫(yī)生根據(jù)傳統(tǒng)的醫(yī)療影像,雖然可以判定疾病類型,但是由于肺部形狀不規(guī)則,發(fā)病部位往往十分復(fù)雜,因此對(duì)診治造成困難,難以量化分析,而且醫(yī)生也難提供個(gè)性化治療方案。但是基于深度學(xué)習(xí)的人工智能診斷,可以快速給出診斷意見,并且診斷率達(dá)78%,遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于目前的臨床診斷準(zhǔn)確率。程國(guó)華強(qiáng)調(diào),未來,健培科技將會(huì)陸續(xù)對(duì)幾十種疾病進(jìn)行實(shí)驗(yàn)分析。

  GPU耗能和數(shù)據(jù)流傳輸怎破?

  醫(yī)療影像大數(shù)據(jù)與一般的數(shù)據(jù)不同,一般的大數(shù)據(jù)是數(shù)據(jù)量大,但單個(gè)文件不大。而醫(yī)療影像大數(shù)據(jù)是單個(gè)文件超大。在進(jìn)行云計(jì)算時(shí),GPU資源消耗特別大,而且耗能耗電會(huì)造成系統(tǒng)的不穩(wěn)定。云計(jì)算平臺(tái)是深度學(xué)習(xí)技術(shù)的基礎(chǔ)平臺(tái),因此,解決GPU耗能問題將是對(duì)醫(yī)學(xué)影像進(jìn)行智能化分析的關(guān)鍵。

  在談到此問題時(shí),程國(guó)華表示,繪圖運(yùn)算在電影中的應(yīng)用已經(jīng)相當(dāng)成熟了,但是,我們平時(shí)看到的維妙維真的動(dòng)畫,其實(shí)背后的GPU耗能很大。往往一部動(dòng)畫電影做完至少需要三年的時(shí)間,如大型動(dòng)畫電影《瘋狂動(dòng)物城》,整整做了七年,才呈現(xiàn)出我們現(xiàn)在看到的震撼畫面。動(dòng)畫不僅僅是呈現(xiàn)圖片那么簡(jiǎn)單,它需要大量的渲染,因此其背后的運(yùn)算量十分耗能耗時(shí)。如果海量的非結(jié)構(gòu)化影像數(shù)據(jù)全部采用GPU作為計(jì)算單元,醫(yī)院將需要支付巨額的服務(wù)器和電力使用費(fèi)用,對(duì)機(jī)房的建設(shè)也有嚴(yán)格的要求,不利于產(chǎn)品的推廣、部署和使用。程國(guó)華解釋,健培科技自主研發(fā)的基于FPGA架構(gòu)的影像分析可以解決GPU運(yùn)算性能功耗高的問題,F(xiàn)PGA架構(gòu)特點(diǎn)是在低功耗的情況下完成高強(qiáng)度的計(jì)算任務(wù),有助于深度學(xué)習(xí)技術(shù)真正的應(yīng)用于臨床實(shí)踐。

  另外,醫(yī)療影像數(shù)據(jù)有別于其他機(jī)器視覺應(yīng)用數(shù)據(jù)的一大特點(diǎn)是圖像的連續(xù)性,單張圖像不具備分析價(jià)值,只有連續(xù)的圖像序列才能對(duì)病照進(jìn)行完整分析,比如一個(gè)病照的CT影像常由多個(gè)切片構(gòu)成,只有通過三維重構(gòu)將所有的病照切片構(gòu)建成三維模型,計(jì)算機(jī)才能更好的進(jìn)行分析診斷。健培科技自主研發(fā)的三維圖像深度學(xué)習(xí)計(jì)算引擎在醫(yī)療行業(yè)屬于首創(chuàng),與傳統(tǒng)的圖像深度卷積網(wǎng)不同,三維的卷積網(wǎng)在網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)和并行計(jì)算方面都面臨巨大挑戰(zhàn),并且沒有現(xiàn)存的框架和庫(kù)可以使用,健培科技通過大量的實(shí)驗(yàn)和探索,研制出了計(jì)算性能(訓(xùn)練和測(cè)試時(shí)間消耗)和精確度都得到醫(yī)院客戶認(rèn)可的深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),其中有五項(xiàng)獲得發(fā)明專利。

  政產(chǎn)學(xué)研用融合推動(dòng)智慧醫(yī)療

  眾所周知,物聯(lián)網(wǎng)、移動(dòng)互聯(lián)及深度學(xué)習(xí)技術(shù)的迅猛發(fā)展,給醫(yī)療產(chǎn)業(yè)帶來廣闊的發(fā)展契機(jī),但是,無論是醫(yī)療信息化的建設(shè)還是幫助醫(yī)療,必須以政產(chǎn)學(xué)研用相結(jié)合的模式共同推動(dòng),否則,任何一方孤軍奮戰(zhàn)都是一意孤行,無法真正的推動(dòng)智慧醫(yī)療落地。

  程國(guó)華表示,在國(guó)家醫(yī)改政策的大背景下,政產(chǎn)學(xué)研用缺一不可,醫(yī)療大數(shù)據(jù)分析項(xiàng)目必須聯(lián)合當(dāng)?shù)卣?、衛(wèi)計(jì)委、研究院、企業(yè)、醫(yī)院主體等共同推動(dòng)醫(yī)療產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。今年5月份,健培科技與哈爾濱南崗區(qū)簽訂項(xiàng)目戰(zhàn)略合作協(xié)議,健培科技投資7億落戶到哈爾濱南崗區(qū)的醫(yī)療大數(shù)據(jù)項(xiàng)目,是政產(chǎn)學(xué)研用相融合模式的典范。健培科技聯(lián)合哈爾濱市政府、衛(wèi)計(jì)委、哈醫(yī)大、三甲醫(yī)院的戰(zhàn)略合作,共同推動(dòng)哈爾濱市醫(yī)療大數(shù)據(jù)互聯(lián)互通,使醫(yī)療資源整合共享,最大限度的發(fā)揮醫(yī)療大數(shù)據(jù)的價(jià)值和優(yōu)勢(shì),盡快將最新技術(shù)成果用之于民。

  據(jù)了解,本醫(yī)療大數(shù)據(jù)中心項(xiàng)目主要致力于醫(yī)學(xué)影像大數(shù)據(jù)分析和存儲(chǔ),建立人工智能診斷系統(tǒng),實(shí)現(xiàn)機(jī)器輔助醫(yī)生對(duì)疾病進(jìn)行診斷,主要是以幫助診療的方式來推動(dòng)國(guó)內(nèi)智慧醫(yī)療建設(shè)。

  另外,運(yùn)用深度學(xué)習(xí)技術(shù)的智能診斷,對(duì)影像質(zhì)量要求十分高,因此醫(yī)學(xué)影像必須嚴(yán)格符合一定的拍片標(biāo)準(zhǔn),才能更好進(jìn)行分析與智能運(yùn)算,但是醫(yī)療影像質(zhì)量的標(biāo)準(zhǔn)化沒有那么簡(jiǎn)單,必須聯(lián)合政府、醫(yī)療、專家及協(xié)會(huì)共同研究與制定。據(jù)悉,健培科技正在積極聯(lián)合北京、上海大醫(yī)院以及解放軍第三零九醫(yī)院等其他幾家地方醫(yī)院來推動(dòng)影像質(zhì)量與拍片標(biāo)準(zhǔn)化工作,過程雖然不易,真正落地或許也要3-5年時(shí)間,但這是未來的大趨勢(shì)。

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